Ο Άγιος Ανδρέας (ή Αντρέι) ήταν Αρωμανικής καταγωγής, ή όπως θα τον έλεγαν οι Έλληνες, Βλάχος, και οι γονείς του, Ναούμ και Αναστασία, κατάγονταν από το Γκράμποβα στην Αλβανία. Λόγω εμπορικών ενδιαφερόντων, εγκαταστάθηκαν στο Μίσκολτς της Ουγγαρίας. Ο Άγιος Ανδρέας γεννήθηκε εκεί, ως το νεότερο από τρία παιδιά, στις 20 Δεκεμβρίου 1808 και βαπτίστηκε με το όνομα Αναστάσιος. Με την καθοδήγηση των τοπικών Ιησουϊτών, ο Ναούμ είχε αποφασίσει να στραφεί η οικογένεια στον Ρωμαιοκαθολικισμό, ελπίζοντας να αποκτήσει καλύτερη κοινωνική θέση από αυτή που προοριζόταν για τους περισσότερους Ορθοδόξους υπηκόους των Αψβούργων. Ωστόσο, οι Σαγούνας, με παρότρυνση της Αναστασίας, συνέχισαν να παραμένουν Ορθόδοξοι κρυφά – ο μελλοντικός Μητροπολίτης και τα δύο αδέλφια του πιθανότατα ποτέ δεν ασκούσαν τον Καθολικισμό. Κατά τη διάρκεια των σπουδών του στην Πέστη, όπου μελέτησε φιλοσοφία και νομικά στο Πανεπιστήμιο της Πέστης, φιλοξενήθηκε από τον θείο του Αθανάσιο, όπου επιφανείς λόγιοι εξέφραζαν ανησυχία...